The present invention relates to a novel structure of nucleic acid complex in which bioactive nucleic acid can be introduced into cells, to a composition comprising the nucleic acid complex for treatment and diagnosis of diseases, and to a method for regulating the expression of a target gene using the same and, more specifically, to a nucleic acid complex in which a bioactive nucleic acid is complementarily combined with a carrier peptide nucleic acid modified to have a positive charge overall, to a composition comprising the nucleic acid complex for treatment and diagnosis of diseases, and to a method for regulating the expression of a target gene using the same.본 발명은 생활성 핵산을 세포내에 도입할 수 있는 새로운 구조의 핵산 복합체, 이를 포함하는 질병의 치료 및 진단용 조성물 및 이를 이용한 표적 유전자의 발현 조절 방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는, 생활성 핵산과 전체적으로 양전하를 가지도록 변형된 캐리어 펩티드 핵산(Carrier Peptide Nucleic Acid)이 상보적으로 결합된 핵산 복합체 이를 포함하는 질병의 치료 및 진단용 조성물 및 이를 이용한 표적 유전자의 발현 조절 방법에 관한 것이다.