Provided are a Pseudomonas protegens mutant strain Pf5-NiF, Pf5-ΔretS, or Pf5-ΔretS-NiF, and a screening method therefor and an application thereof. By means of Red/ET recombination and direct cloning technologies, NiF nitrogen fixation gene islands in the genome of Pseudomonas stutzeri DSM4166, taken as a whole, are cloned into the genome of Pseudomonas protegens Pf5, so as to heterologously express same successfully to obtain a genetically engineered strain Pf5-NiF, thereby bringing a biological nitrogen fixation function to Pseudomonas protegens Pf5 which does not own a biological nitrogen fixation function. In addition, gene-directed markerless knockout of retS genes in the genome of Pseudomonas protegens Pf5 is performed to obtain a genetically engineered strain Pf5-ΔretS. Thus, the expression levels of an antibiotic 2,4-diacetylphloroglucinol and red pigment are increased, and a mutant strain of Pseudomonas protegens Pf5 having a stronger bactericidal activity is obtained.L'invention concerne une souche mutante de Pseudomonas protegens Pf5-NiF, Pf5-ΔretS, ou Pf5-ΔretS-NiF, et un procédé de criblage associé ainsi qu'une application de celle-ci. Au moyen de technologies de recombinaison Red/ET et de clonage direct, des îlots de gènes de fixation d'azote NiF dans le génome de Pseudomonas stutzeri DSM4166, pris dans sa totalité, sont clonés dans le génome de Pseudomonas protegens Pf5, de manière à l'exprimer de manière hétérologue avec succès pour obtenir une souche génétiquement modifiée Pf5-NiF, amenant ainsi une fonction de fixation d'azote biologique à Pseudomonas protegens Pf5 qui ne possède pas de fonction de fixation d'azote biologique. De plus, une inactivation sans marqueur dirigée par un gène de gènes retS dans le génome de Pseudomonas protegens Pf5 est effectuée pour obtenir une souche génétiquement modifiée Pf5-ΔretS. Ainsi, les niveaux d'expression d'un antibiotique 2,4-diacétylphloroglucinol et de pigment rouge sont augmentés, et une souche mutante d