The present invention provides a nucleic acid having a suppressive activity of MASP2, a pharmaceutical composition comprising the nucleic acid, and an autoimmune disease such as APS and SLE containing the nucleic acid, or a preventive or therapeutic agent for thrombosis in hemodialysis.本発明は、MASP2の発現抑制活性を有する核酸、該核酸を含む医薬組成物ならびに該核酸を含むAPS、SLEなどの自己免疫疾患ならびに血液透析における血栓症の予防または治療薬を提供する。