本发明提供柳枝稷液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因PvNHX1的cDNA,其特征在于,核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明还提供克隆权利要求1所述柳枝稷液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因PvNHX1的cDNA的方法,具体步骤为:(1)提取柳枝稷总RNA,反转录成cDNA;(2)以cDNA为模板,以PvNHX1基因全长特异性引物对进行高保真全长PCR反应;(3)回收和纯化步骤(2)的PCR产物,并进行加A反应,得到柳枝稷液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因PvNHX1的cDNA。本发明获得了柳枝稷PvNHX1基因全长cDNA序列的方法,为以后利用该序列进行构建载体、遗传转化等奠定了基础。