In one embodiment, the invention relates to a method of treating a patient with breast or ovarian cancer comprising receiving an assay result telling that the patient's tumor exhibits LOH and administering a PARP inhibitor. . In one embodiment, the present invention: the data is determined by the sum of the length of each individual LOH region divided by i) one or more deleterious mutations in BRCA1 or BRCA2, or ii) the entire genome length If it contains a proportion of genomes with LOH greater than 10% (where the LOH region is defined as being homozygous at multiple adjacent single nucleotides, but excludes LOH of the entire chromosome or chromosome arm) Classifying the cancer patient by a computer system as likely to respond to the inhibitor. [Selection] Figure 1一実施形態では、本発明は、患者の腫瘍がＬＯＨを示すことを告げているアッセイ結果を受領すること、及びＰＡＲＰ阻害剤を投与することを含む、乳癌または卵巣癌の患者を治療する方法に関する。一実施形態では、本発明は：データが、ｉ）ＢＲＣＡ１もしくはＢＲＣＡ２における１つ以上の有害な突然変異、またはｉｉ）ゲノム全長によって除された各個々のＬＯＨ領域の長さの合計によって決定される１０％超のＬＯＨを有するゲノムの割合（ここでＬＯＨ領域は複数の近接単一ヌクレオチドにおけるホモ接合性の存在と定義されるが、染色体全体または染色体腕のＬＯＨは除外する）を含む場合、ＰＡＲＰ阻害剤に応答する可能性があるとしてコンピュータシステムによって前記癌患者を分類することを含む。【選択図】図１
