A system for analysis of biopsy samples includes a tissue sample transport mechanism linking a biopsy sample excision tool to a tissue sample holder disposed in a staging area of an analysis unit. The tissue sample is automatically transported from the excision tool to the specimen holder, where the tissue sample is analyzed in the staging area of the analysis unit. The transport mechanism may include tubing and a vacuum source. The tissue sample holder may be configured to slow or temporarily stop a tissue sample for individual analysis, or collect multiple tissue samples for analysis as a group. A tissue sample sorting mechanism may be employed that allows separation of specimens that can be correlated to the analysis.La présente invention concerne un système d'analyse d'échantillons de biopsie qui comprend un mécanisme de transport d'échantillon de tissu reliant un outil d'excision d'échantillon de biopsie à un support d'échantillon de tissu disposé dans une zone de présentation d'une unité d'analyse. L'échantillon de tissu est automatiquement transporté de l'outil d'excision au support d'échantillon, l'échantillon de tissu étant analysé dans la zone de présentation de l'unité d'analyse. Le mécanisme de transport peut comprendre une tubulure et une source de vide. Le support d'échantillon de tissu peut être configuré pour ralentir ou temporairement arrêter un échantillon de tissu pour une analyse individuelle, ou pour prélever de multiples échantillons à analyser comme un groupe. Un mécanisme de tri d'échantillons de tissu peut être utilisé, qui permet la séparation des échantillons qui peuvent être corrélés à l'analyse.