本发明公开了一种适于毕赤酵母表达的高比活植酸酶基因及其制备方法和表达。所述适于毕赤酵母表达的高比活植酸酶基因的核苷酸序列如SEQ ID NO 1所示,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO 2所示。本发明对来源于大肠杆菌的APP2植酸酶基因按照毕赤酵母偏爱密码子优化,采用连续延伸PCR方法合成植酸酶APPA2基因,并在原核表达载体上采用DNA重组技术建立突变文库,电击转入毕赤酵母,筛选出高比活植酸酶基因APPA2-1。将本发明制备的高比活植酸酶基因构建到毕赤酵母表达载体并转化入毕赤酵母中表达,可用于高比活植酸酶的生产。