本发明公开了一种抗剪切淀粉生物合成重组基因YXII及其应用,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,从大肠杆菌JM109‑3突变株中分离获得了腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶编码基因的glgC55,从马铃薯分别分离获得了腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶AGPase小亚基编码基因SSU cDNA和与淀粉粒结合的淀粉合成酶编码基因GBSSI启动子。其中,glgC55编码431个氨基酸组成的AGPase亚基,其中有4处特异突变,它们分别是K39E,V71A,I248V和K304E,前两者出现在寡聚亚基N端代谢基团的Rossmann折叠区域内,后两者出现在寡聚亚基C端异构调控和寡聚化的LbH基团内。