PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an image processing system, an image processing apparatus, and an image processing method that are capable of executing accurate measurement processing that determines the distance between two pairs of coordinates set in a stereoscopic image.SOLUTION: An image processing system of an embodiment includes a receiving unit, an acquiring unit, a measuring unit, and an output unit. The receiving unit receives two pairs of coordinates in a stereoscopic image, as a sample, displayed by a stereoscopic image display apparatus. The acquiring unit acquires volume data coordinates corresponding to stereoscopic image coordinates representing the received pairs of coordinates. The measuring unit executes measurement processing that determines the distance between the two pairs of coordinates received by the receiving unit. The output unit outputs the result of the measurement by the measuring unit.【課題】立体画像に設定された座標間の距離を測定する測定処理を正確に実行可能となる画像処理システム、画像処理装置及び画像処理方法を提供することである。【解決手段】実施の形態の画像処理システムは、受付部と、取得部と、測定部と、出力部とを備える。受付部は、立体画像表示装置にて表示されている被検体の立体画像における二つの座標の設定を受け付ける。取得部は、受け付けられた座標を示す立体画像座標に対応する座標であるボリュームデータ座標を取得する。測定部は、取得部により取得されたボリュームデータ座標に基づいて、受付部により受け付けられた二つの座標間の距離を測定する測定処理を実行する。出力部は、測定部による測定結果を出力する。【選択図】図1