The present invention relates to a sterilization system using electromagnetic wave emission and a sterilization method thereby and, specifically, to a sterilization system using electromagnetic wave emission and a sterilization method thereby, which are capable of preventing propagation of specific microorganisms by discharging electromagnetic waves harmful to microorganisms to a generation area of microorganisms. The sterilization system using electromagnetic wave emission according to the present invention comprises: a data storage device (11) for storing data on various frequency bands of at least one microorganism or bacteria; an electromagnetic wave generation module (12) for generating an electromagnetic wave of a frequency band for sterilization on the basis of sterilization data including the frequency bands transmitted from the data storage device (11); and an electromagnetic wave control unit (14a, 14b) disposed in at least one sterilization area (S1, S2) to emit electromagnetic waves of a frequency band included in the sterilization data in a predetermined direction.COPYRIGHT KIPO 2018본 발명은 전자파 방출에 의한 살균 시스템 및 그에 의한 살균 방법에 관한 것이고, 구체적으로 미생물에 유해한 전자파를 미생물의 발생 영역에 방출시켜 특정 미생물의 번식을 방지하는 전자파 방출에 의한 살균 시스템 및 그에 의한 살균 방법에 관한 것이다. 전자파 방출에 의한 살균 시스템 및 그에 의한 살균 방법은 적어도 하나의 미생물 또는 세균의 다양한 주파수 대역에 대한 데이터가 저장된 데이터 저장장치(11); 데이터 저장장치(11)로부터 전송된 주파수 대역을 포함하는 살균 데이터에 기초하여 살균을 위한 주파수 대역의 전자파를 발생시키는 전자파 생성 모듈(12); 및 적어도 하나의 살균 영역(S1, S2)에 배치되어 살균 데이터에 포함된 주파수 대역의 전자기파를 정해진 방향으로 방출하는 전자파 조절 유닛(14a, 14b)을 포함한다.