The invention provides methods, compositions and kits for segregating a target nucleic acid from a mixed nucleic acid sample. The methods, compositions and kits comprise a non-processive endonuclease (e.g., a restriction enzyme) or an antibody that binds the target nucleic acid (e.g., has methylation specificity). The mixed nucleic acid sample can comprise prokaryotic and eukaryotic nucleic acid and/or nucleic acid from more than one prokaryotic or eukaryotic organisms.Linvention concerne des procédés, des compositions et des kits pour séparer un acide nucléique cible dun déchantillon dacide nucléique mixte. Les procédés, les compositions et les kits comprennent une endonucléase non processive (par exemple, une enzyme de restriction) ou un anticorps qui se lie à lacide nucléique cible (par exemple, ayant une spécificité de méthylation). Léchantillon dacide nucléique mixte peut comprendre un acide nucléique prokaryote et eukaryote et/ou un acide nucléique provenant de plus dun seul organisme prokaryote ou eukaryote.
