Described herein are methods of treating multiple sclerosis (MS), such as secondary progressive MS (SPMS), by intrathecally administering a B cell depleting agent, such as rituximab, alone or in combination with intravenous administration of a B cell depleting agent. Also described is the use of IL-12p40, CXCL13, or both as CSF biomarkers for selecting a patient with progressive MS as a candidate for treatment with an intrathecal immunomodulatory therapy, and for identifying a progressive MS patient as having meningeal inflammation. The present disclosure also describes a method of evaluating the effectiveness of a therapy for treating progressive MS by measuring the level of IL-12p40, CXCL13, or both in the CSF of the patient before and after treatment. A decrease in the level of IL-12p40, CXCL13, or both after treatment indicates the therapy is effective for treating progressive MS.La présente invention concerne des méthodes de traitement de la sclérose en plaques (MS), telles que la MS secondaire progressive (SPMS), par ladministration intrathécale dun agent de déplétion de lymphocytes B, tel que rituximab, seul ou en combinaison avec une administration intraveineuse dun agent de déplétion de lymphocytes B. Linvention concerne également lutilisation dIL-12p40, de CXCL13 ou des deux comme biomarqueurs de CSF, pour la sélection dun patient atteint dune MS progressive comme candidat pour le traitement par une thérapie immunomodulatrice intrathécale, et pour lidentification dun patient atteint de MS progressive comme présentant une inflammation méningée. La présente invention concerne également un procédé dévaluation de lefficacité dune thérapie pour le traitement de MS progressive par la mesure du niveau dIL-12p40, de CXCL13 ou des deux dans le CSF du patient avant et après traitement. Une diminution du niveau dIL-12p40, de CXCL13 ou des deux après le traitement indique que la thérapie est efficace pour le traitement de la MS progressive.