Compositions include programmable nucleases with targeting mechanisms to prevent off-target cleavage of genetic material. Compositions may include a programmable nuclease such as a CRISPR-associated (Cas) endonuclease complexed with a short guide RNA sequence and linked to a DNA-binding domain from, for example, a TALE, ZFN, or Bat protein such that the guide RNA and the DNA-binding domain target separate target sequences in a target viral genome and binding of both is required to the Cas endonuclease to cleave the bound genetic material. Compositions and methods may also include using a single-strand DNA oligo complementary to a targeting region sequence on a guide RNA-Cas endonuclease complex to competitively block mismatched binding of the targeting region sequence.Les compositions comprennent des nucléases programmables possédant des mécanismes de ciblage pour empêcher le clivage de matériel génétique à lextérieur de la région ciblée. Les compositions peuvent comprendre une nucléase programmable telle quune endonucléase associée à CRISPR (Cas), complexée à une courte séquence dARN guide et liée à un domaine de liaison à lADN issu par exemple dun TALE, dun ZFN ou une protéine Bat, de telle sorte que lARN guide et le domaine de liaison à lADN ciblent des séquences cibles distinctes au sein dun génome viral cible et que la liaison des deux soit nécessaire pour que lendonucléase Cas clive le matériel génétique lié. Les compositions et les méthodes peuvent également comprendre lutilisation dun oligonuclotide de type ADN monocaténaire complémentaire dune séquence de région de ciblage sur un complexe ARN guide-endonucléase Cas pour bloquer de manière compétitive la liaison non appariée de la séquence de région de ciblage.
