本发明涉及一个降低种子重量的白桦AP2基因及其编码蛋白,属于分子生物学中的基因技术领域,其特征在于降低游离脂肪酸及可溶性蛋白合成,从而降低拟南芥种子重量,白桦AP2基因的序列如序列表SEQ ID NO:1所示;其编码的蛋白的氨基酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示。本发明提供白桦花发育相关基因AP2并用于构建白桦AP2基因的植物表达载体,构建的植物表达载体经农杆菌浸染拟南芥植株,获得转基因拟南芥植株且转基因纯系植株所结种子中游离脂肪酸含量及可溶性蛋白含量均有所下降,表明该基因具有降低拟南芥种子游离脂肪酸及可溶性蛋白含量的功能并且能够调控两种物质的生物合成途径。本发明为利用基因工程技术调控种子发育提供了基因资源与理论依据,具有很大的应用价值。