本发明公开了一种茎瘤芥BjuA036398基因在调控植物侧根发育中的应用,所述BjuA036398基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,利用转基因技术调控BjuA036398的cDNA序列在拟南芥中过量表达,相比于野生型植株,获得了侧根数目明显增加的转基因植物,表明茎瘤芥BjuA036398基因具有调控植物侧根发育的重要生物学功能。通过提高BjuA036398基因的表达量,能增加植物侧根数目,提高植物从土壤中吸收养分的能力。BjuA036398基因新功能的发现为植物侧根发育调控提供了新的基因靶点和资源,茎瘤芥BjuA036398基因可广泛应用于植物遗传育种、种质资源改良和培育,对改进和改良茎瘤芥等作物的种质资源具有重要作用。