The present invention relates to the use of one or more biomarkers to evaluate the likelihood that a rapamycin analog would produce an anti-cancer effect in a subject. It is based, at least in part, on the results of experiments employing an integrated next-generation sequencing approach to interrogate spatially separated tumor specimens from the same individuals to decipher intra-tumor and intertumor heterogeneity and determine the oncogenomic basis of exceptional therapeutic benefit to rapalogs in kidney cancer patients. These experiments implicated loss of function mutations in TSC1 and/or TSC2 and/or gain-of- function of mTOR in therapeutic responsiveness to rapamycin analogs. Accordingly, in non-limiting embodiments, the present invention provides for assay methods and kits for determining the presence of loss of function mutations in TSC1 and/or TSC2 and/or gain-of- function of mTOR, and methods of using such determinations in selecting a therapeutic regimen for a cancer patient and in methods of treating cancer patients. In particular non-limiting embodiments, a plurality of tumor sites are evaluated and the composite effect of the genetic background on mTOR function is assessed.La présente invention concerne l'utilisation d'un ou de plusieurs biomarqueurs pour évaluer la probabilité qu'un analogue de la rapamycine produise un effet anti-cancéreux chez un patient. L'invention est basée, au moins en partie, sur les résultats d'expériences utilisant une approche intégrée de séquençage de nouvelle génération afin d'interroger spatialement des échantillons tumoraux séparés issus de mêmes individus pour déchiffrer l'hétérogénéité intertumorale et intratumorale et déterminer la base oncogénomique d'un effet bénéfique thérapeutique exceptionnel pour des rapalogues chez des patients atteints d'un cancer du rein. Ces expériences ont impliqué une perte de mutations des fonctions dans TSC1 et/ou TSC2 et/ou un gain de fonction de mTOR dans la sensibilité thérapeutique au
