Provided is a method of detecting the presence of genetically modified cells in a subject. The method comprises detecting a first transgene from the cells in a cell-free fraction of a first sample from the subject. In this method, the sample is a bodily fluid, the transgene is not part of the genome of the subject, and the transgene is not part of the natural genome of the cells.L'invention concerne un procédé de détection de la présence de cellules génétiquement modifiées chez un sujet. Le procédé comprend la détection d'un premier transgène à partir de cellules dans une fraction acellulaire d'un premier échantillon provenant du sujet. Dans ce procédé, l'échantillon est un fluide corporel, le transgène ne fait pas partie du génome du sujet, et le transgène ne fait pas partie du génome naturel des cellules.