Provided herein are methods for predicting the LKB1 status of a patient or a biological sample, comprising the measurement of particular gene expression levels relative to a set of reference levels that represent the gene expression level of a biological wild-type sample without LKB1 gene or protein loss or mutation and the gene expression level of a reference sample with LKB1 gene or protein loss or mutation. Further provided herein are methods for treating and/or preventing a cancer or a tumor syndrome in a patient, comprising administering an effective amount of a TOR kinase inhibitor to a patient having cancer or a tumor syndrome, characterized by particular gene expression levels.本明細書に示されているのは、患者または生物学的なサンプルのLKB1の状態を予測する方法である。当該方法は、LKB1遺伝子またはLKB1タンパク質の減少または変異を有していない野生型の生物学的なサンプルの遺伝子発現レベル、ならびにLKB1遺伝子またはLKB1タンパク質の減少または変異を有している基準サンプルの遺伝子発現レベルを表す一組の基準レベルに対する、特定の遺伝子発現レベルを測定することを包含している。さらに、本明細書に示されているのは、患者におけるがんまたは腫瘍症候群を処置するか、および/または予防する方法である。当該方法は、特定の遺伝子発現レベルによって特徴づけられているがんまたは腫瘍症候群にかかっている患者に、有効量のTORキナーゼ阻害剤を投与することを包含している。