本发明公开了一种β－甘露聚糖酶及其表达方法与专用工程菌。该酶是具有下述氨基酸残基序列之一的蛋白质：1)序列表中的SEQ ID №：1；2)将序列表中SEQ ID№：1的氨基酸残基序列经过一至十个氨基酸残基的取代、缺失或添加且对甘露聚糖具有降解作用的蛋白质。专用工程菌是将含有该β－甘露聚糖酶成熟蛋白编码序列的毕赤酵母表达载体导入毕赤酵母中得到的。该工程菌实现了β－甘露聚糖酶的高效表达，且发酵工艺简单，提取成本低廉，适于大规模工业化生产。本发明的β－甘露聚糖酶及其工程菌将在β－甘露聚糖酶的工业化生产及动物饲料添加剂的制备中发挥重要作用，应用前景广阔。
