禾本科植物内生真菌研究19:圆柱披碱草内生真菌的系统发育学研究

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作   者：

王志伟;  张晨炜;  詹漓晖;  亢燕;  纪燕玲; 

作者机构：

南京农业大学生命科学学院; 

关键词：

系统发育分析;  tubB;  圆柱披碱草;  tefA;  Epichloe属真菌; 

期刊名称：

南京农业大学学报

基金项目：

我国Neotyphodium属内生真菌的分类、起源和遗传多样性研究
内生真菌对鹅观草的影响及其机理研究

i s s n：

1000-2030

年卷期：

2016 年 39 卷 03 期

页   码：

408-416

摘   要：

[目的]本文旨在确定圆柱披碱草(Elymus cylindricus)内生真菌的分类地位。[方法]选择5株分离自新疆、青海的圆柱披碱草内生真菌菌株,采用SDS法提取基因组DNA,利用选择性引物对其tub B和tef A基因片段进行扩增和克隆测序,下载NCBI中的相似序列并进行比对分析,用MEGA 6.0软件构建系统发育树。[结果]成功获得差异极小的各菌株序列,且tub B序列确认为仅1个拷贝,而2个菌株的tef A序列则有2个拷贝。在最大简约树上披碱草菌株的tef A和tub B第1拷贝均在EBY(Epichloe bromicola/E.yangzii)大支上,与E.sinica比较接近;tef A的第2拷贝与ETC(E.typhina complex)中的成员聚类。[结论]Epichloesp.-Elymus cylindricus是一个新的共生体组合。圆柱披碱草分离菌株为杂交起源的Epichloe属真菌,可能起源于E.bromicola(syn.E.yangzii)和E.sylvatica间的杂交。