玉米泛素活化酶基因家族鉴定及表达模式分析

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作   者：

赵秋芳;  贾利强;  马海洋;  陈曙;  陈宏良; 

作者机构：

中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室; 

关键词：

生物信息学;  玉米;  泛素活化酶;  基因表达; 

期刊名称：

玉米科学

基金项目：

i s s n：

1005-0906

年卷期：

2018 年 01 期

页   码：

8-14+19

摘   要：

通过生物信息学分析,从B73玉米全基因组中鉴定出4个泛素活化酶基因,分别命名为Zm UBA1~Zm UBA4。4个Zm UBA基因编码氨基酸数目在1 030~1 056 aa,编码蛋白分子量在114.63~117.39 k D,等电点在5.18~5.80,且均含有5个内含子。蛋白二级结构预测,4个基因编码的蛋白主要以α–螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位预测4个基因均定位于细胞核中。荧光定量PCR结果表明,Zm UBA1基因在根、茎、叶、雄穗和雌穗中呈现组成性表达,Zm UBA2和Zm UBA4基因在雄穗表达量最高,Zm UBA3在叶片表达量最高,呈现组织特异性表达。Zm UBA3在盐和低温胁迫上调表达,Zm UBA4在盐胁迫时下调表达,说明Zm UBA3基因可能参与玉米低温和盐胁迫的应答,Zm UBA4可能参与玉米盐胁迫应答。