苏云金芽胞杆菌Sigma54和CcpA共同调控的基因鉴定

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作   者：

程海舰;  彭琦;  张杰;  宋福平; 

作者机构：

东北农业大学生命科学学院;  中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室; 

关键词：

Sigma54;  转录调控;  苏云金芽胞杆菌;  CcpA; 

期刊名称：

微生物学报

基金项目：

苏云金芽胞杆菌母细胞裂解和晶体细胞分化的机理研究

i s s n：

0001-6209

年卷期：

2018 年 03 期

页   码：

380-390

摘   要：

【目的】通过综合分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)HD73菌株Sigma54缺失突变体的转录组数据和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)ATCC 14579菌株CcpA缺失突变体的转录组数据,并进行启动子与CcpA蛋白的体外结合验证,明确Bt HD73菌株中Sigma54和CcpA共同调控的基因,丰富了对微生物的代谢调控网络的认识。【方法】以转录组测序结果为基础,通过基因同源性的比对在Bt HD73菌株中寻找受Sigma54和CcpA共同调控的基因,在这些基因中找到具有cre序列的启动子,通过凝胶阻滞验证这些启动子与CcpA蛋白的结合。【结果】Bt HD73菌株中有31个基因受Sigma54和CcpA共同调控,其中14个基因的启动子序列包含cre序列,这些启动子都可以与CcpA蛋白发生体外结合。【结论】Bt HD73菌株中有14个基因直接受CcpA的调控,同时其转录受Sigma54的控制。