许氏平鲉Sebastes schlegelii)TRAF基因的鉴定及其响应杀鱼爱德华氏菌侵染的表达模式研究

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作   者：

刘显通;  王宁宁;  吴瑞雪;  李超;  曹敏; 

作者机构：

青岛农业大学动物科技学院; 

关键词：

TRAF;  免疫应答;  信号传导;  许氏平鲉;  表达模式; 

期刊名称：

海洋与湖沼

i s s n：

0029-814X

年卷期：

2024 年 55 卷 001 期

页   码：

232-242

摘   要：

TRAF是机体内一种具有信息传导作用的胞内因子,承担多个受体家族的信号转导工作,在固有免疫以及获得性免疫方面都发挥出重要作用.TRAF作为一类胞内接头蛋白,对多条信号途径的活化具有一定的影响,包括细胞的增殖、生存、凋亡、炎症反应、免疫反应等.目前已有研究表明鱼类中的TEAF基因也发挥重要的免疫防疫作用.以许氏平鲉为研究对象,基于基因组和转录组的数据库,进行了许氏平鲉TRAF基因家族的系统鉴定.在许氏平鲉中共鉴定到9个TRAF基因,并对这些TRAF基因的长度和氨基酸个数进行了统计分析.同时,分析了这9个TRAF基因的结构特征.选取了包括许氏平鲉在内的6种鱼类进行了TRAF基因的共线性分析.结果显示,TEAF基因在硬骨鱼类中具有保守的共线性.通过系统发育分析,更好地解析了 TRAF家族基因的进化关系,同时也证明了对其鉴定及命名的准确性.此外,还进行了TRAF家族基因的蛋白质相互作用网络预测以及表达模式分析.通过蛋白质相互作用的网络分析,得到TRAF基因与其互作蛋白的关联状况.在杀鱼爱德华氏菌侵染许氏平鲉后的不同时间点,探究TRAF基因在杀鱼爱德华氏菌刺激下的表达模式.定量结果显示,除TRAF4.1外,其他TRAF基因在感染后均存在不同程度的上调.综上所述,从分子水平上揭示了许氏平鲉TRAF家族基因的结构和功能,揭示了TRAF可能依赖的免疫通路,为进一步探究TRAF家族基因在许氏平鲉先天免疫过程中的作用奠定了基础.