盐胁迫下比拉底白刺差异表达基因的转录组分析

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作   者：

田林;  尹丹丹;  成铁龙;  夏新莉;  尹伟伦; 

作者机构：

中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室;  北京林业大学生物科学与技术学院;  南京林业大学生物与环境学院; 

关键词：

差异表达基因;  盐胁迫;  功能分析;  比拉底白刺;  转录组; 

期刊名称：

林业科学研究

i s s n：

1001-1498

年卷期：

2020 年 01 期

页   码：

1-10

摘   要：

[目的]为了挖掘比拉底白刺耐盐相关基因,对其盐胁迫下差异表达基因进行筛选分析。[方法]以比拉底白刺幼苗为材料,用200 mmol·L~(-1) NaCl对幼苗处理7 d,并对胁迫处理和对照植株叶片进行转录组测序及生物信息学分析。[结果]有效序列组装共得到应答盐胁迫的168 463条unigenes和196个差异表达基因。通过差异基因GO和KEGG功能聚类,分别获得64个GO功能小类和25条KEGG通路。进一步基因相互作用网络分析发现,转录调控、氧化还原以及抗逆相关基因在比拉底白刺应答盐胁迫中发挥重要作用,其中,筛选到3个重要的节点基因,分别是热激同源蛋白基因、L型凝集素类受体激酶基因和Win类蛋白基因。[结论]本研究获得了盐胁迫下比拉底白刺的差异表达基因及功能注释信息,有助于理解其耐盐的分子机制,为后续开发耐盐分子标记及通过基因编辑改良植物耐盐特性提供了科学依据。