大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析

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作   者：

高姗姗;  冯浩;  黄鑫;  张鑫月;  张泽阳;  刘贵河; 

作者机构：

河北北方学院; 

关键词：

生物信息学;  大麦;  CIPK基因家族;  转录组表达量; 

期刊名称：

现代农业科技

i s s n：

1007-5739

年卷期：

2024 年 004 期

页   码：

156-163

摘   要：

钙调神经磷酸酶B样相互作用蛋白激酶(CIPK)蛋白家族是由Ca2+介导的植物信号通路中的关键蛋白家族,在植物抗逆和生长发育中发挥着关键作用.本文利用生物信息学方法和转录组数据分析法,进行了大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析.结果表明,从大麦基因组数据库中鉴定出 31 个大麦CIPK基因家族成员,命名为HvCIPK1~HvCIPK31,这些成员分为 5 个亚族.HvCIPKs基因家族成员具有CIPKs典型的N端激酶结构域和C端NAF调节结构域;蛋白质分子量为 40 302.27~89 926.43 kD,为亲水性蛋白;启动子总共包含 11 种与非生物胁迫、激素调控以及生长发育相关的顺式作用元件;HvCIPKs与Na+和K+转运体、ABA信号通路关键蛋白(SOS1、AKT1 和ABL2)存在相互作用关系;HvCIPK1、HvCIPK2、HvCIPK6、HvCIPK9、HvCIPK11 与响应盐碱胁迫相关.该研究可为进一步探索大麦HvCIPKs基因家族功能及调控机制提供理论依据.